Procesando...Itsuka Shidou es un estudiante de instituto que, durante las vacaciones, vive en primera persona un suceso sin igual. Ante él aparece una chica con armadura, que destruye la ciudad que tiene delante. La chica responde ante el nombre de Tooka, y según la hermana de Shidou, es un espíritu (“seirei”, 精霊), los cuales causaron un terremoto espacio-temporal 30 años atrás. La hermana de Shidou revela que su verdadera identidad es la de la líder de la organización Ratatosk y le cuenta a Shidou que la única manera que tienen de salvar el mundo es hacer que Tooka se acabe enamorando de él y tengan una cita.
Izumi Shinichi, de 17 años, vive con sus padres en un vecindario tranquilo de Tokio. Una noche, unos aliens llamados Parásitos invaden la Tierra, entrando en las mentes de los humanos por las orejas o narices. Un Parásitos intenta entrar en la oreja de Shinichi mientras duerme, pero no puede porque lleva auriculares puestos y entra en su cuerpo por el brazo, ocupando su mano derecha. Como Shinichi no ha dejado que Migi, el alien, llegue hasta su cerebro, desarrollan su intelecto por separado. Al encontrarse con otros Parásitos, crean un vínculo entre ellos, luchando juntos para sobrevivir.
Magia — Un siglo ha pasado desde que este concepto ha sido reconocido como tecnología usual en vez de un producto oculto del folclore. Ya ha llegado la primavera y es tiempo para empezar un nuevo curso escolar. En el instituto Nacional de Magia, los estudiantes se dividen en dos grupos dependiendo de su rendimiento académico. Los “Blooms” que demostraron tener las notas más altas y acuden al “Primer Curso” y los “Weeds,” con resultados académicos bajos y acuden al “Segundo Curso”. Este verano, unos hermanos peculiares ingresarán en el colegio, el chico en los “Weeds y ella en los Blooms”.
La historia es acerca de Yuuki Rito, un muchacho de secundaria que no puede confesarse con la chica de sus sueños, Sairenji Haruna. Un día, cuando el regresó a casa y malhumorado, en la bañera, una misteriosa, chica desnuda, aparece de la nada. Su nombre es Lala y ella viene del planeta Deviluke, donde ella es la heredera al trono. Su padre quiere que ella vuelva a su planeta de origen, lo que le permite contraer matrimonio con uno de los candidatos a marido, pero ella decide que quiere casarse con Rito con el fin de permanecer en la Tierra.
La historia está protagonizada por Kizuna Hida, quien visita la academia de defensa estratégica Ataraxia a petición de su hermana mayor. Allí conoce a Aine Chidorigafuchi, una chica piloto de la armadura mágica Zerosu. Aine acaba quitándose la ropa delante de Kizuna, y tras llamarlo pervertido como es común en estas situaciones en las que el chico no tiene ninguna culpa, pasa a preguntarle si él es “el elegido”. De repente la hermana de Kizuna le envía información sobre una importante misión: ¿Tocar las tetas de Aina?. En realidad es que Kizuna tiene el poder de aumentar de nivel las habilidades de las chicas mediante sus actos indecentes. Estando en combate contra fuerzas de otro mundo, el futuro de la humanidad dependerá del poder de Kizuna.
Shido Itsuka, que solía ser un estudiante de instituto normal en Raizen alta, conoce al primer Espíritu, Tohka, y despierta su poder para "sellar el poder del Espíritu". A pesar de que pueden ser temidos y odiados seres debido a su inmenso poder, los Espíritus estaban siempre solos, y solo conocían el combate y la muerte. Shido, el único en el mundo con el poder para sellar la fuerza de los Espíritus, se lanza y arriesga su vida en las citas con los bellos Espíritus con el fin de salvarlos.
Rikka, la Ciudad Académica sobre el agua. Esta ciudad, también conocida como “Asterisk”, era famosa por ser el mayor escenario del mundo para el espectáculo de combate “Star Wars Festival”. Los jóvenes chicos y chicas de la generación Starpulse entrenan con ahínco para salir vencedores gracias a sus Shining Armaments, y entre ellos está Amagiri Ayato. Ayato llega a Rikka tras recibir una invitación de Claudia, presidenta del consejo de estudiantes de la academia Sidoukan. Pero nada más llegar consigue enfadar a Julis, conocida como la “Petalblaze Witch”, y acaba retándose en duelo con ella.
